由于真嗣的“没有行动”导致碇源堂对他十分失望，他果断发布命令，切除了真嗣与初号机的联系，采取了由【傀儡系统】来操控初号机。

碇源堂的决断为“就算傀儡系统还有很多问题，但是就算如此也比现在的驾驶员要好！”

真嗣的驾驶舱内，脖子被掐住的感觉立刻消失，因为他与初号机的连接被切断了，四周的光线变得昏暗。

初号机由傀儡系统操控，马上开始了反击，同样伸出手掐住了三号机的脖子，慢慢的，初号机站起了身，但从力量上来说，已经完全压制住了三号机。

NERV总部的人员全都不可置信的看着参数，各项增益正在显着提高，看起来，这是来自“傀儡系统”的力量。

真嗣在驾驶舱内就那么眼睁眼看着初号机扭断了三号机的脖子，这还没完，初号机将三号机狠狠摔在地上，一拳砸出，三号机被这一拳砸的血液狂喷！

“呜啊！！！”

初号机发出怒吼，开始疯狂撕扯着三号机，护甲被拆掉，肢体被分解，四周的大楼上全都是鲜血，路边的红绿灯上夜，粘稠的血液一滴滴往下流，边上的河道彻底被染成红色。

“呀灭楼！！！”

“快让他停下！爸爸！！”

“快叫他停下来！”

真嗣在驾驶舱内歇斯底里的大吼。

NERV总部的一众人全都目瞪口呆的看着屏幕，胆小的女性已经用手捂住了脸了...

最终，在真嗣惊恐的眼神中，初号机的手中抓着一个插入栓，也就是驾驶者所在的驾驶舱。

“住手！”

“快住手！”

真嗣疯狂的拉动着手中的操纵杆，但是却没有任何用处。

砰！！

初号机将插入栓捏爆了！

“EVA三号机，不对，目标已经完全瘫痪.....”

NERV总部内，传出了这最后的通知。

目标已被消灭，初号机站立在原地，进入了待机模式。

.......

当天夜里，插入栓回收小组开始了作业，他们得把插入栓带回去，而且三号机留下的残骸，也需要回收进行处理，葛城美里也告诉了真嗣真相，三号机的驾驶员是谁....

这让真嗣痛苦的尖叫，他感觉自己的脑子已经要炸了....